中医科为重庆医科大学附属大学城医院重点建设专科，设有中医门诊、中药房和住院病房，有教授（主任医师）、博士生导师、博士后合作导师、重庆市名中医、重庆市巴渝岐黄学者、重庆市中医学术技术带头人等多名资深中医专家长期坐诊，团队成员已招收硕士研究生100余名、博士研究生10余名及博士后5名。中医科现拥有重庆市中医药重点学科（中医老年医学）1个，开设有中医内科、中医妇科、中医儿科（含儿童抽动障碍中医特色门诊）、中医外科（中医肛肠方向）、中医风湿病科、针灸推拿科及重庆市首个动脉硬化中医特色门诊，坚守中医特色，守正创新，积极开展中西医协同诊疗服务，同时还开展了无痛飞针、董氏奇穴等针法、灸法、拔罐、刮痧、穴位埋线、穴位注射、皮内针、皮肤针、耳针、耳穴贴压、小儿推拿、中药贴敷等多种中医药适宜技术。医院作为重庆医科大学附属医院，中医科还承担了中医药、中西医结合等课程的教学及科研任务，团队拥有较强的中医（中西医结合）临床、科研和教学能力，先后主持主研国家自然科学基金、重庆市科技局、重庆市卫健委、重庆市教委等各级科研项目50余项，主编、副主编或参编国家规划本科及研究生教材、专著40余部，发表SCI、CSCD、中文核心等论文200余篇。中医科以服务重庆西部及科学城片区为主，辐射周边省市，以精湛的医术、个性化诊疗、负责任的态度，竭诚为广大患者提供优质的中医药（中西医结合）诊疗服务。